Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV1-8P0DP01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms