Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms