Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms