Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L5P0DN76 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms