Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms