Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR89BP0CG08 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR89BP0CG08 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms