Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPA1P09661 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPA1P09661 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms