Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGAP02671 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGAP02671 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGAP02671 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGAP02671 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms