Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD4O95243 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD4O95243 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD4O95243 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms