Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRATO95237 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms