Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TIPRLO75663 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms