Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms