Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms