Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNC1O60486 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms