Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms