Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA5O60264 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms