Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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