Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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