Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP3O43295 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms