Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC4O15439 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC4O15439 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms