Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSPB6O14558 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB6O14558 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms