Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms