Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DFFAO00273 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms