Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms