Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms