Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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