Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB9F8W1W9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms