Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DIRC3C9JPN6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms