Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms