Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms