Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms