Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DSR2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DSR2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DSR2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DSR2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms