Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM90A7PA6NKC0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms