Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23AA6NH52 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23AA6NH52 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms