Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6BA6NDN3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms