Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms