Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms