Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms