Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms