Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RQF3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms