Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms