Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms