Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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