Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC49-203ENST00000443425 3085 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-2Q9BYQ4 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms