Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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