Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms