Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms