Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP16Q9Y5T5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP16Q9Y5T5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms