Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms