Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms